宇宙世纪0096年后半，感受到「精神感应框架」存在胁威的地球联邦政府，下达了一个重要指令。其内容为命令隶属直辖情报部的梅米特·梅鲁加中尉，率领旗下的特殊部队「莫斯提马」，潜入并调查漂流于由地球圈的小行星──「阿克西斯（AXIS）」分离的半边区域。
和梅米特同行的调査队成员中，有过去曾于吉翁公国丶新吉翁担任技术人员和测试驾驶员的两位民间人士，其名为艾鲁丽特·马里亚热和丹顿·哈力古。
潜入阿克西斯的调査队，在理当无人的基地中受到私人民兵集团「巴纳姆」的新型「高达」袭击，而丹顿和艾鲁丽特也以过去经手开发的红色「渣古III改」应战，过程遭遇了各种危险的局面。
而在这之中，艾鲁丽特带着心中隐藏的「思念」，往留在阿克西斯表面的沙萨比残骸的方向前进……